Game lấy bối cảnh giả tưởng diễn ra năm 1985, và việc có các siêu anh hùng chiến đấu chống lại cái ác như trong truyện tranh là có ngoài đời thực. Đây là thời điểm căng thẳng nhất của cuộc Chiến Tranh Lạnh giữa Mỹ và Liên Bang Xô Viết và một chiếc đồng hồ giả định đã được đếm ngược tới ngày cuộc chiến Hạt nhân sẽ diễn ra (được gọi bằng DoomsdayClock và Minutes To Midnight). Câu chuyện bắt đầu bằng cuộc điều tra của Rorschach vào vụ ám sát một cựu siêu anh hùng nổi tiếng - The Comedian mà từ nó đã dẫn tới hàng loạt những vụ thủ tiêu các siêu anh hùng nhằm che giấu 1 bí mật khủng khiếp sẽ khiến lịch sửphải thay đổi